2001年成功申报为外科学二级学科博士学位授权点，临床医学一级学科博士后培养基地。骨外科学、神经外科学批准为广东省A类重点学科，2000年至2005年荣获国家科技进步二等奖共3项，军队及广东省科技进步、医疗成果一等奖8项，军队科技进步、医疗成果及广东省科技进步二等奖13项；获国家863计划重大专项课题、广州市重大科技攻关项目、广州市科委科技攻关项目、军队后勤技术重大成果推广项目、军队十五重点课题、广东省名医工程等科研课题127项、约1342.5万元，有1位为总后院士后备人选，有1位选为国务院学位委员会学科评议组成员、获国家级有突出贡献的中青年科学技术专家及全国中青年医学科技之星 。外科学课程的教学改革，取得良好的教学效果，并获得第一军医大学教学成果一等奖2项、二等奖2项、三等奖2项。有1位教师被评为全军及总后优秀教师并获得全军院校育才银奖，11位教师被确定为博士生导师、25位教师被确定为硕士生导师。培养的多名研究生分别获南粤跨世纪优秀博士生及南粤优秀研究生一、二等奖，完成全国教育科学国防军事教育学科“九五”规划课题1项，广东省“五个一百”电化教学项目1项，总后卫生部“双百几乎”电化教学项目1项、校级教学研究课题3项、院级教学研究课题17项，主编出版外科学教材及专著38部。多媒体技术应用水平高，教学硬件条件优越,教学研究成绩显著，教学效果好。课程总体上处于国内先进水平。